Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDIL3O43854 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms