Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms