Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H3BML4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BML4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BML4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BML4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BML4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H3BML4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H3BML4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms