Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms