Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E9PBE3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E9PBE3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E9PBE3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms