Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCP1A6NGW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms