Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOLGA6L9A6NEM1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms