Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms