Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK1Q9UPV9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms