Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1BQ9UPS6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms