Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX6Q9UPM6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms