Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3Q9UJ98 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3Q9UJ98 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms