Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPC1L1Q9UHC9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms