Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRPC4Q9UBN4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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