Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DNAJC28Q9NX36 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms