Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms