Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A20Q9NP91 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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