Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM55Q9BYV6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM55Q9BYV6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms