Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACTRT3Q9BYD9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTRT3Q9BYD9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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