Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms