Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM106CQ9BVX2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms