Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TMEM208Q9BTX3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TMEM208Q9BTX3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms