Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms