Protein–RNA interactions for Protein: Q99619

SPSB2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB2Q99619 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPSB2Q99619 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms