Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ELF4Q99607 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms