Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNFT2Q96EX2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms