Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDS1Q92903 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms