Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS8Q8N3P4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms