Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG4DQ86TL0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms