Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF554Q86TJ5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms