Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms