Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT28Q7Z3Y7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms