Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SV2AQ7L0J3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms