Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGP8Q6NSW7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms