Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP170Q5SW79 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms