Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RFTN2Q52LD8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms