Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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