Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CA9Q16790 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CA9Q16790 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms