Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLPPQ16740 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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