Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCAQ16586 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCAQ16586 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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