Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN9AQ15858 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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