Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUM3Q15397 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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