Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HERC3Q15034 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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