Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COL9A3Q14050 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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