Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPA4Q13156 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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