Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFX1Q12986 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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