Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTP4A2Q12974 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTP4A2Q12974 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTP4A2Q12974 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTP4A2Q12974 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTP4A2Q12974 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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