Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FOXI1Q12951 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms