Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CENPEQ02224 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms