Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms